Nærings- og fiskeridepartementet har i et brev til Sjøfartsdirektoratet varslet at NIS-skip ikke lenger kan gå med last eller passasjerer mellom havner på Svalbard eller mellom Svalbard og fastlandet. Årsaken er at Svalbard skal betraktes som norsk innenriks havn, og dermed faller innunder fartsområdebegrensningene i NIS-loven.
Departementet har drøftet saken med Justisdepartementet og Utenriksdepartementet med bakgrunn i en konkret sak der Svalbards status som innenriks eller utenriks havn var avgjørende. Departementet avgjorde at Svalbard skal betraktes som norsk havn. Tolkningen innebærer konsekvenser for rederier med NIS-registrerte fartøy som går med last eller passasjerer mellom havner på Svalbard, mellom Svalbard og Fastlands-Norge eller i fast rute med passasjerer mellom Svalbard og utenlandsk havn. Slik fart er ikke tillatt ut fra fartsområdebegrensningene i NIS-loven § 4. Departementet har i samme brev bedt direktoratet informere disse rederiene om den nye tolkningen av lovverket, samt å «praktisere fortolkningen lempelig inntil den er allment kjent i næringen».
Sjøfartsdirektoratet har begynt arbeidet med identifisere hvilke rederier som har NIS-registrerte fartøy som anløper Svalbard, og som heretter kan komme i konflikt med NIS-loven i forhold til tolkningen av Svalbards status som norsk havn. Noen rederier er allerede varslet, men det vil ta noe tid å informere de relevante rederiene. Sjøfartsdirektoratet vil be rederiene vurdere registreringen av sine skip, og er innstilt på en dialog med næringen for å finne gode løsninger. Direktoratet har også startet arbeidet med å gjennomgå regelverket for å identifisere hvor det bør gjøres endringer basert på den nye tolkningen.